Al conectar el ARS-USB al equipo, un nuevo puerto serial será agregado al sistema. La configuración entre el programa MacDoppler y el ARS-USB es la siguiente: 

1) Ir a Preferencias, y seleccionar el Serial Port asociado al ARS-USB:

El ARS-USB aparecerá como un dispositivo usbmodem. En este caso como: usbmodem000011

2) Seleccionar el tipo de interface: Yaesu GS-232-B

3) Puedes seleccionar cualquiera de las velocidades, por ejemplo 9600

4) El resto de opciones según preferencias

Mi agradecimiento a Karl por la cesión del video y aclaraciones al mismo.